1914年デンマーク、トナー生まれ。17歳の若さで木工マイスターの資格を取得、1936年にコペンハーゲンの手工芸学校で家具デザインを学び、 1943年アルネ・ヤコブセンの建築事務所で働く。1946年に独立し、1949年ラウンドチェア（後のThe Chair）、50年にはウィッシュボーンチェア（後のY-Chair）等、のちに代表作と呼ばれるようになる椅子を次々と発表。以降フリッツ・ハンセン、PPモブラー、ヨハネス・ハンセン社など多くのメーカーのデザインを手がける。
ウェグナーは父親譲りの優れた家具職人でもあり、「座りやすさ」、「クラフトマンシップ」、「デザインの美しさ」を設計する際のポリシーに掲げ、その生涯に500種類以上の椅子をデザインしています。その多くが高い評価を得て、世界中の美術館でパーマネントコレクションとして収められています。